Villakärpänen ei kerää asiakkaiden henkilötietoja eikä yrityksellä ole kattavia asiakastietorekistereitä. Ainut asiakasrekisteri ovat laskutusohjelman laskutustiedot, jotka ovat salasanalla suojattuna tietokoneella. Laskujen kopiot säilytetään kirjapidon mapeissa kotona, eikä niihin ole ulkopuolisilla pääsymahdollisuutta. Kopiot hävitetään polttamalla lain vaatiman ajan jälkeen.